Kể từ sau khi được kiện toàn, Chính phủ luôn xác định việc xử lý các vấn đề tồn tại của một số dự án chậm tiến độ, kém hiệu quả, thua lỗ là nhiệm vụ quan trọng và tập trung chỉ đạo thường xuyên, liên tục, quyết liệt. Đây là những nhiệm vụ rất khó khăn, phức tạp, trong khi thời gian, nguồn lực lại có hạn, không thể cùng lúc xử lý tất cả mà phải phân loại, lựa chọn một số dự án để làm trước, làm dứt điểm. Sau đó tiếp tục rút kinh nghiệm, phát huy cách làm tại những dự án được xử lý thành công để giải quyết vướng mắc cho các dự án khác.