Kết thúc ngày thi thứ nhất kỳ thi tốt nghiệp THPT 2009, việc tiếp tục tăng cường thanh tra, kiểm tra, giám sát đã góp phần duy trì kỷ luật phòng thi. Số thí sinh vi phạm quy chế bị phát hiện và bị đình chỉ thi giảm nhiều so với kỳ thi năm 2008. Tuy nhiên, vẫn còn một số điểm tồn tại ở một số ít Hội đồng coi thi.